本来天启皇帝的身体已经有些恢复，按照太医院的说法，这病是身子病也是心病，国家危难，天子心里压得东西太多太重，承受不起崩溃，才引起的这个病症，所以一定不能操心，实际上宫内和外朝也都是这样的安排，可莫名其妙的，这个奏报就送到了天启皇帝跟前，信王朱由检想要拦都来不及了。
对这件事的传闻有很多，不过追究已经毫无意义，不管从法统还是什么来讲，都是信王朱由检继位，现在是新君当国，一切都要围着他来转了，内廷外朝对这个也早有准备，信王朱由检即皇帝位，年号崇祯..
相比于把魏忠贤摆上前台，自己躲在后面的天启皇帝朱由校，崇祯皇帝朱由检就稚嫩很多，不过身为大明皇帝，对赵家军渡海北伐，民心大意开始变化的事情怎么也没办法宽心，有人说他继位之后就要调集兵马南征，崇祯皇帝还在朝会上算了一笔账，京营十二万、宣府八万、蓟镇八万，山西十一万，这四十万兵马倾巢而出，足足是那徐州贼的十倍，怎么也能大胜。
只是他说出这个倡议之后，即便是被他重新启用的东林大臣们都磕头阻止，首辅孙承宗和诸位内阁大学士则是准备辞官对抗，但崇祯皇帝觉得自己没什么错，下面的人之所以这般，是因为胆怯贪鄙，但出兵征伐这件事还是无疾而终，原因也很简单，当得知这个传闻后，京营上下都开始不闻，开小差的逃兵增多，甚至有人密谋兵变，其他边镇也有些暗藏机锋的奏报送上来。
这些反应直接给崇祯皇帝浇了凉水，再怎么热血沸腾，这兵变的威胁可是实实在在的，以文驭武，文贵武贱，这些规矩已经开始变化了，一场场战斗打下来，文官身份再怎么贵重也不管事，还是要靠武将军兵拿刀子去拼，朝廷为了让人卖命，也不敢随意处置武将，这让武将军方的势力愈发坐大，很多事都只能捏着鼻子装看不见或者认了，彼此间维持个体面。
既然一时间对反贼奈何不得，那就要清理奸邪，对魏忠贤一党的清算开始了，只不过这清算说不上怎么酷烈，倒不是政争中大家要留手，而是魏忠贤这边所做没那么过分，若没有赵进自徐州起兵，魏忠贤和阉党的行事或许会走向一个极端，可因为徐州赵家军的一步步行动，魏忠贤步步应对，反而让人挑不出什么毛病。
当时大喊魏阉祸国，行事荒唐，包藏祸心，可事后看来，这些做法都很有道理，完全是为大局着想，更有趣的是，东林清流还在这其中掌权数次，还对赵家军发动攻击，然后大败亏输，其中责任最重大的一件事就是京城被炮轰，朝廷被迫求和割地，这桩事却是在东林当政的时候发生，清流领袖杨涟和左光斗都没办法否认，只能说贼人势大，不得不如此，这是为了江山社稷的不得不为。
这么算计起来，魏忠贤这边的罪过也说不上那么大了，只能说他败坏国政，坐视徐州贼人壮大，其余的就是些构陷贪墨的罪名，以及朝着三大案上攀扯，这些在明眼人身上都是靠不住的，也只能拿出来罗织。
本来很多人咬牙切齿要把魏忠贤活剐了，其他人也是万劫不复的重罪，可算计下来，根本没办法重判，即便崇祯皇帝对魏忠贤同样厌恶，还有人说魏忠贤曾经想要谋害他，也同样没办法下重手。
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